- Genel olarak antikolinerjik ve spazmolitik etki ile kolon, ince barsak ve mide spazmlarında. - Akut mantar zehirlenmelerinde antidot olarak 1-2 mg deri altına. - Organik fosfor zehirlenmelerinde her yarım saatte bir i.m. olarak 3 mg atropin enjekte edilir. - Kardiyopulmoner resusitasyon esnasında hipotansiyon ve sık ektopik atışların eşlik ettiği sinüs bradikardisinin tedavisinde, hiperaktif karotid sinüs refleksine bağlı olarak oluşan, bradikardinin de eşlik ettiği vagal senkop tedavisinde. - Rezerpin, guanetidin ve kolinerjik uyarıyla oluşan gastrointestinal hipermotilitenin ve diyarenin tedavisinde. - Parkinson sendromunda ve ilaç kaynaklı ekstrapiramidal reaksiyonlarda, özellikle aşırı tükrük salgılanmasını önlemede. - Genel anestezi öncesi kalbin vagal inhibisyon riskini ve tükrük ile bronşiyal salgıyı azaltmada. - Myasthenia graviste istenmeyen muskarinik etkileri en aza indirgemek için. - i.v. yoldan uygulanan 1 mg atropin, duodenal ve kolonik motilite ve spazmı azaltarak hipotonik duodenografi ve kolonun kontrast incelenmesinde kullanılır; ancak bu amaçla glukagonun kullanımı tercih edilir.