Pantpas 40 mg Enterik Kaplı Tablet, ketokonazol gibi biyoyararlanımı pH'ya bağlı ilaçların absorbsiyonunu azaltabilir. Pantoprazol, karaciğerde sitokrom P450 enzim sistemi ile metabolize olur. Aynı enzim sistemiyle metabolize olan diğer ilaçlarla veya bileşiklerle pantoprazol arasında etkileşme gözardı edilemez. Buna rağmen, karbamazepin, kafein, diazepam, diklofenak, digoksin, etanol, glibenklamid, metoprolol, nifedipin, fenprokumon, fenitoin, teofilin, varfarin ve bir oral kontraseptif ile yapılan spesifik testlerde klinik önemi olan etkileşme gözlenmemiştir. Antasitlerle birlikte verildiğinde etkileşme görülmemiştir. Klaritromisin, metronidazol ve amoksisilin ile klinik açıdan etkileşme gözlenmemiştir.