Bütün aminoglikozid verilen hastalarda olduğu gibi gentamisin tedavisi sırasında da hasta bu sınıf ilaçların potansiyel olarak toksik olduğu göz önünde tutularak yakın bir klinik izlemeye alınmalıdır. Gentamisin2in nefrotoksisite riski doz arttıkça, tedavi uzadıkça ve böbrek fonksiyonu bozuldukça fazlalaşır. Aynı şey nörotoksisite için de geçerlidir. Ri,zikolu hastalarda gentamisin serum seviyeleri tayin edilmeli ve maksimum değerleri geçmemesine dikkat edilmelidir. vertigo işitme kaybı, uyuşma, konvülsiyon , tinnitus, nistagmus gibi ototoksisite belirtileri izlenmeli, gerekirse seri audiogramlar yapılmalıdır. Nefrotoksisite için proteinüri, hipostenüri, silindirüri, BUN, serum kreatinin ve klirensi tayini yapılmalıdır. Toksisite şüphesi varsa doz azaltılır veya ilaç kesilir. Ototoksisite genellikle riversibldir. Genthaver ampul, formülünde sodyum metabisülfit içerdiğinden özellikle astımlı hastalar da anafilaksi dahil allerjik tipte reaksiyonlara yol açılabilir.