Helicol, genellikle iyi tolere edilenbir ilaçtır. Bazı hastalarda, döküntü, kaşıntı gibi aşırı duyarlılık belirtileri görülebilir. Bu tür aşırı duyarlılık belirtilerinin ortaya çıktığı hastalarda tedaviye son verilmelidir. Bazı hastalarda, karaciğer transaminazlarında yükselme görülebilecğinden, özellikle karaciğer bozukluğu olan hastalar yakından izlenmelidir. Ayrıca, ender olarak anemi, lökopeni, eozinofili, kabızlık, diyare bulantı, ağız kuruluğu, karında şişkinlik, baş ağrısı, uyku hali uykusuzluk ve ateş görülebilir. Bu yan etkiler genelikle hafif ve geçicidir, tedavinin kesilmesine gerek göstermez.