Penisilin tedavisi uygulanan hastalarda ciddi ve bazen fatal anaflaktoid reaksiyonlar bildirilmiştir. Bu tip reaksiyonlar özellikle birçok alerjene duyarlılığı olan kişilerde ve parenteral uygulamada oral uygulamaya göre daha sık görülmüştür. Bu nedenle penisilin tedavisine başlamadan önce penisilin, sefalosporin ve diğer alerjenlere karşı önceden aşırı duyarlılık reaksiyonu olup olmadığı iyice soruşturulmalıdır. Alerjik reaksiyonlar görüldüğü taktirde ilaç kesilmeli ve gerekli tedaviye başlanmalıdır. Ciddi anaflaktoid reaksiyonların epinefrin ile tedavisi gerekir. Ayrıca I,V. steroidler, oksijen uygulaması, solunum yolunun açık tutulması yapılması gereken işlemlerdir. Gebelikte kullanımı: Gebelik sırasında mutlak gerekmedikçe kullanılmamalıdır. İlaç anne sütüne geçtiği için emziren annelerde kullanımı sırasında dikkatli olunmalıdır. Uzun süreli tedavi tüm güçlü ilaçlarda olduğu gibi hematopoetik sistem, renal ve hepatik fonksiyonlar periyodik olarak izlenmelidir. Tedavi sırasında bakteriyel patojenler (Enterobakter, Pseudomonas) ve mantarlarla (Candida) süperenfeksiyon ihtimali göz önünde bulundurulmalıdır. Böyle bir durumda ilaç kesilmeli ve uygun tedaviye başlanmalıdır.