Lincocin'in kullanımı sırasında, ağır diyare ve psödomembranöz kolit vakaları bildirilmiştir.Lincocin, bir gastro-intestinal sistem hastalığı, özellikle koliti olan kişilerde, dikkatli kullanılmalıdır. Serebrospinal sıvıya geçmediğinden, menenjit tedavisinde önerilmez. Lincocin steril solüsyonu, damar içinde sulandırılmadan verilmemeli, sulandırıldıktan sonra 10-60 dakika içinde uygulanmalıdır. Uzun süreli tedavilerde, karaciğer ve böbrek fonksiyonları yakından izlenmelidir. Tedavi sırasında, preparata duyarlı olmayan mikroorganizmalar, özellikle maya mantarları üreyebilir. Lincocin, nöromüsküler blokaj yapan ilaçların etkisini arttırdığından, bu ilaçları kullanan hastalarda dikkatli kullanılmalıdır. İlacın gebelikte kullanımı araştırılmamıştır. Yeni doğanda, Lincocin kullanımı önerilmez. Atopik kişilerde kullanırken dikkatli olunmalıdır. Benzil alkol içermesi nedeni ile 2 yaşından küçük çocuklarda kullanılmamalıdır.