Gastrointestinal : Morfazinamidin temel yan etkisi hepatik reaksiyondur. Hepatotoksisite doza bağlıdır ve tedavinin herhangi bir zamanında görülebilir. Bunun dışında bulantı, kusma ve iştahsızlık olabileceği de bildirilmiştir. Hematolojik : Trombositopeni, eritroid hiperplazi ile birlikte sideroblastik anemi, serum demir konsantrasyonunda artma gibi yan etkiler nadiren oluşabilir. Diğerleri : Nadiren, hafif artralji ve miyalji oluşabilir. Döküntü, ürtiker ve kaşıntı gibi aşırı duyarlılık reaksiyonları nadiren görülebilir. Ateş, akne, ışık hassasiyeti, porfiri, dizüri ve interstisiyel nefrit nadiren görülebilir.