20 mg/ 40 mg/ 80 mg/ 120 mg/ 160 mg: İlaç her ne kadar önerilen doz ve aralarla uygulandığında yan etki pek meydana gelmesse de, özellikle böbrek yetmezliği olanlarda ve yüksek doz ve uzun süre kullanımında ortaya çıkabilen nefrotoksik ve ototoksik yan etkileri en ciddi olanlarıdır. Nefrotoksik yan etkiler idrarda silindirlerin, hücrelerin veya proteinlerin mevcudiyeti ile saptanabileceği gibi BUN, NPN,serum kreatinin yükselmesi ya da oligüri ile de kendini gösterebilir.
Ototoksik yan etkiler ise 8. kafa çiftinin hem vestibüler hem de işitme dallarında oluşur. Bunlar sersemlik, baş dönmesi, kulak uğultusu ve çımlaması ile işitme kaybıdır. İşitme kaybı genellikle önce yüksek seslerin keskinliğinin azalmasıyla kendini gösterir. Muhtemelen gentamisine bağlı olan diğer yan etkiler: Solunum depresyonu, letarji, konfüzyon, depresyon, görüntü bozuklukları, iştah azalması, kilo kaybı ve hipotansiyon ile hipertansiyon; kızarıklık, kaşıntı, ürtiker, genel yanma hissi, mide ifrazı artışı ve stomatit; purpura, pseudotümörserebri, akut organik beyin sendromu, pulmoner fibrozia, alopesi, eklem ağrısı, geçici hepatomegali ve splenomegalidir.
Gentamisine bağlanabilecek labaratuar bozukluıkları:Serum transaminaz, serum LDH ve bvilürobin seviyelerinde artma; serum kalsiyum, magnezyum, sodyum ve potasyumunda azalma, anemi, lökopeni, granülositopeni, geçici agranülositoz, eosinofili, retikulozit sayısında artma veya azalma ve trombositopenidir. Aminolikozidler ile tedavi gören hastalar, kullanımlarına bağlı potansiyel toksisiteden dolayı yakın klinik gözetim altında tutulmalıdırlar. Genta 40 ampulde tüm diğer aminoglikozitler gibi potansiyel açıdan nefrotoksittir. Nefrotoksisite riski, böbrek fonksiyonları bozuk olan hastalar ile yüksek doz alanlar veya uzun süre kullananlarda çok daha fazladır. Genta 40 ampul ile tedavi edilen hastalarda ortaya çıkabilen hem vestigüler hem de işitme ile ilgili ototoksisite, asasen önceden böbrek fonksiyon bozukluğu olanlar ile yüksek doz ve tavsiye edi,lenden daha uzun süre kullanan böbrek fonksiyonu normal hastalarda görünür. Ototoksisite dışındaki diğer nörotoksik belirtiler ise uyuşukluk, cildde uyuşma hissi, kas seyirmesi ve konvülsiyondur.
Genta Göz Kulak damlası %0.3 geçici irritasyon yapabilir.