Sefagen tedavisine başlamadan önce, hastanın daha önce sefotaksim sodyum'a sefalosporinlere, penisilinlere yada başka ilaçlara aşırı duyarlık reaksiyonu gösterip göstermediği dikkatle sorulmalıdır. Sefagen, penisiline karşı Tip I aşırı duyarlığı olan hastalara dikkatli verilmelidir. Sefagen'e karşı alerjik reaksiyon görüldüğünde tedavi kesilmelidir. Ciddi aşırı duyarlık reaksiyonları epinefrin ve diğer acil önlemleri gerektirebilir. Sefalosporinlerin ve diğer geniş spektrumlu antibiyotiklerin kullanımı sırasında psödomembranöz kolit vakaları bildirilmiştir. Bu nedenle antibiotik kullanımı sırasında diyare görülen hastalarda psödomembranöz kolit olasılığı dikkate alınmalıdır. Sefagen nefrotoksik değildir. Buna rağmen böbrek yetmezliği nedeniyle idrar miktarı azalmış olan hastalarda günlük doz uygun biçimde azaltılmalıdır. Diğer antibiyotiklerde olduğu gibi, uzun süreli Sefagen kullanımında da duyarlı olmayan organizmalar üreyebilir. Süperenfeksiyon gelişirse gerekli önlemler alınmalıdır. Sefagen'in tek başına kullanımında nefrotoksisite görülmemesine rağmen aminoglikozidlerle birlikte kullanıldığında bu olasılık artabilir. Mutajenik testler negatif bulunmuştur. Gebelikte Kullanım: Yapılan hayvan deneylerinde malformasyon ve fetüse zararlı etki görülmemesine rağmen Sefagen, gebe kadınlarda, özellikle gebeliğin ilk üç ayında ancak kesin endikasyon varsa kullanılmalıdır. Emziren annelerde dikkatli kullanılmalıdır.