Mirena rahim boşluğuna yerleştirilir.
Uygulamadan önce, kadın Mirena'nın etkinliği, riskleri ve yan etkileri hakkında bilgilendirilmelidir. Memeleri de dahil eden bir jinekolojik muayene yapılmalı ve bir gebeliğin olmadığı saptanmalıdır. Uygulamadan 4-12 hafta sonra kadın tekrar muayene edilir. Klinik açıdan daha yakın bir takip gerekmiyorsa kontrol muayeneleri yılda bir kez yapılır.
Fertil çağdaki kadınlarda, Mirena rahim boşluğunda siklusun ilk 7 günü içinde uygulanır. Mirena kullanım süresinin sonunda siklusun herhangi bir gününde yeni bir Mirena rahim içi sistemle değiştirilebilir. Sistem ilk trimestr düşüklerini takiben hemen yerleştirilebilir. Doğum sonrası uygulamalar doğumdan 6 hafta sonra yapılmalıdır.
Mirena estrogen replasman tedavisi sırasında endometriumu korumak amacıyla kullanılacaksa, amenoreik kadında herhangi bir zamanda ya da menstrüasyonun ya da çekilme kaanamasının son günlerinde uygulanabilir.
Sistem 5 yıl sonra çıkarılmalıdır. Kadın aynı metoda devam etmek istiyorsa aynı seansta yeni bir sistem yerleştirilebilir. Sistem siklusun ortasında çıkarılıp hemen yeni bir sistemle değiştirilmezse ve kadının o hafta içersinde cinsel münasaebeti olmuş ise gebelik riski mevcuttur.